Skip to main content

Table 2 Transmission approach: TDT results of 30 from 96 tested SNPs in 210 families of the German Asthma Family Study. Shown are only SNPs with at least one TDT results of p < 0.05. The underlined 11 SNPs also appear in table 3.

From: Asthma families show transmission disequilibrium of gene variants in the vitamin D metabolism and signalling pathway

SNP

Gene

Genomic position HG17

MAF

P asthma

P log(IgE)

P log(25- OH-D3)

P log(1,25- OH2-D3)

rs3024498

IL10

1203329924

0,26

0,2654

0,4625

0,0093

0,4479

rs1518111

IL10

1203333040

0,22

0,7087

0,0487

0,4962

0,6031

rs10000076

IL10

1203334410

0,02

0,3711

0,2364

0,2374

0,0030

Il10-571CA

IL10

1203334805

0,24

0,0247

0,3310

0,5889

0,3857

rs1800895

IL10

1203334867

0,01

0,0039

0,5237

0,1152

0,3891

rs1800894

IL10

1203335061

0,03

0,7773

0,5154

0,0101

0,1727

rs222040

GC

4072981967

0,43

0,9211

0,0163

0,3829

0,0662

rs7041

GC

4072983369

0,43

0,8812

0,0249

0,3884

0,0827

rs221999

GC

4073014083

0,24

0,1475

0,2755

0,0027

0,1920

rs1042714

ADRB2

5148186666

0,40

0,8532

0,8492

0,0139

0,7524

rs1433048

IL12B

5158688423

0,18

0,3452

0,5814

0,4184

0,0339

rs2546890

IL12B

5158692478

0,45

0,0236

0,9066

0,5667

0,1599

rs10500804

CYP2R1

11014866849

0,45

0,2242

0,0418

0,0833

0,8352

rs1562902

CYP2R1

11014874792

0,43

0,1342

0,0443

0,1063

0,8049

rs10766197

CYP2R1

11014878456

0,48

0,4700

0,0284

0,0459

0,7258

rs7975232

VDR

12046525104

0,49

0,2484

0,0400

0,9235

0,9351

rs2239186

VDR

12046555677

0,19

0,0350

0,7521

0,9212

0,5459

rs1805011

IL4R

16027281373

0,11

0,2334

0,0090

0,1110

0,2684

C406R

IL4R

16027281467

0,15

1,0000

0,0255

0,6542

0,1249

rs1805015

IL4R

16027281681

0,16

0,8744

0,0003

0,4956

0,1197

Q551R

IL4R

16027281901

0,25

0,2482

0,0017

0,9661

0,8287

rs1805016

IL4R

16027282428

0,05

0,2076

0,0082

0,0002

0,7390

rs10000306

CARD15

16049288266

0,04

0,6473

0,0417

0,4739

0,5429

rs3135499

CARD15

16049323628

0,37

0,0374

0,2742

0,3929

0,8405

rs2045387

IL12RB1

19018061586

0,24

0,6826

0,7907

0,0145

0,3191

rs2296241

CYP24A1

20052219626

0,50

0,0046

0,9291

0,8917

0,5098

rs17219315

CYP24A1

20052221853

0,02

0,8658

0,6289

0,0095

0,3056

rs2762942

CYP24A1

20052222332

0,04

0,7140

0,1506

0,2030

0,0397

rs2248137

CYP24A1

20052223150

0,39

0,0256

0,8250

0,2567

0,9096

rs2248359

CYP24A1

20052224925

0,36

0,0158

0,9302

0,2284

0,8510