Table 3 Case-control approach: Multivariate regression results of 31 from 96 tested SNPs in 408 parents of the German Asthma Family Study adjusted for age, sex and month of examination. Shown are only SNPs with at least one p < 0.05 for heterocygotes and homocygote carriers of the minor allele. The underlined 11 SNPs also appear in table 2.
SNP | Gene | P asthma | P log(IgE) | P log(25-OH- D3) | P log(1,25-OH2-D3) | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Â | Â | heterocygote | homocygote | heterocygote | homocygote | heterocygote | homocygote | heterocygote | homocygote | ||||||||
|  |  | ß coeff. | P | ß coeff. | P | ß coeff. | P | ß coeff. | P | ß coeff. | P | ß coeff. | P | ß coeff. | P | ß coeff. | P |
rs3024498 | IL10 | 0,132 | 0,837 | -0,140 | 0,822 | 0,875 | 0,034 | 1,026 | 0,011 | 0,002 | 0,984 | 0,068 | 0,575 | -0,022 | 0,819 | 0,014 | 0,883 |
Il10571CA | IL10 | 1,731 | 0,024 | 1,225 | 0,080 | 0,446 | 0,362 | 0,241 | 0,608 | 0,171 | 0,290 | 0,252 | 0,110 | -0,080 | 0,484 | -0,090 | 0,421 |
rs6811536 | SPP1 | 0,215 | 0,632 | 0,266 | 0,555 | 0,532 | 0,069 | 0,687 | 0,019 | 0,159 | 0,112 | 0,149 | 0,136 | -0,048 | 0,528 | -0,038 | 0,623 |
rs3213119 | IL12B | -13,300 | 0,988 | -13,765 | 0,988 | 2,221 | 0,149 | 2,950 | 0,050 | -0,125 | 0,799 | -0,124 | 0,795 | -0,063 | 0,869 | -0,090 | 0,808 |
rs2853694 | IL12B | -0,295 | 0,394 | -0,845 | 0,020 | 0,212 | 0,288 | 0,272 | 0,216 | -0,076 | 0,241 | -0,092 | 0,200 | 0,069 | 0,173 | 0,003 | 0,952 |
rs3181216 | IL12B | 0,729 | 0,058 | 0,972 | 0,013 | -0,306 | 0,231 | -0,300 | 0,238 | 0,086 | 0,322 | 0,191 | 0,029 | 0,090 | 0,180 | 0,051 | 0,446 |
rs1433048 | IL12B | 0,632 | 0,412 | 0,595 | 0,427 | 0,916 | 0,077 | 1,074 | 0,034 | 0,082 | 0,658 | 0,019 | 0,916 | 0,063 | 0,656 | 0,037 | 0,792 |
rs2546890 | IL12B | -0,367 | 0,293 | -0,808 | 0,026 | 0,166 | 0,391 | 0,272 | 0,199 | -0,059 | 0,355 | -0,074 | 0,291 | 0,002 | 0,969 | -0,033 | 0,547 |
rs3132299 | RXRA | -15,303 | 0,986 | -15,118 | 0,987 | 0,803 | 0,181 | 0,383 | 0,517 | 0,032 | 0,873 | 0,108 | 0,587 | 0,319 | 0,042 | 0,366 | 0,018 |
rs877954 | RXRA | -0,433 | 0,301 | -0,258 | 0,551 | 0,345 | 0,163 | -0,119 | 0,640 | 0,175 | 0,029 | 0,156 | 0,059 | 0,031 | 0,616 | -0,003 | 0,965 |
rs10500804 | CYP2R1 | 0,279 | 0,394 | 0,287 | 0,434 | 0,212 | 0,323 | 0,421 | 0,077 | 0,069 | 0,323 | 0,191 | 0,014 | 0,032 | 0,554 | -0,001 | 0,982 |
rs1562902 | CYP2R1 | -0,071 | 0,846 | 0,020 | 0,960 | -0,020 | 0,930 | 0,026 | 0,917 | -0,108 | 0,143 | -0,202 | 0,011 | 0,038 | 0,517 | 0,050 | 0,426 |
rs10766197 | CYP2R1 | -0,112 | 0,733 | 0,014 | 0,970 | 0,259 | 0,202 | 0,377 | 0,104 | 0,074 | 0,266 | 0,181 | 0,017 | 0,032 | 0,532 | -0,018 | 0,757 |
rs1544410 | VDR | -0,105 | 0,786 | -0,268 | 0,496 | -0,350 | 0,145 | -0,149 | 0,544 | 0,041 | 0,592 | 0,111 | 0,165 | -0,120 | 0,040 | 0,047 | 0,441 |
rs2239185 | VDR | 0,620 | 0,041 | 0,554 | 0,110 | -0,184 | 0,352 | -0,187 | 0,408 | -0,022 | 0,730 | -0,007 | 0,920 | -0,110 | 0,028 | -0,034 | 0,544 |
rs2239186 | VDR | -0,274 | 0,669 | 0,289 | 0,641 | 0,638 | 0,121 | 0,558 | 0,160 | -0,268 | 0,040 | -0,163 | 0,193 | -0,218 | 0,036 | -0,156 | 0,119 |
rs2228570 | VDR | 0,708 | 0,104 | 0,834 | 0,058 | 0,481 | 0,108 | 0,653 | 0,029 | -0,100 | 0,279 | -0,073 | 0,435 | -0,042 | 0,537 | -0,001 | 0,988 |
rs238532 | CYP27B1 | -0,449 | 0,577 | 0,626 | 0,214 | 0,647 | 0,144 | -0,075 | 0,813 | -0,025 | 0,857 | 0,081 | 0,463 | 0,281 | 0,009 | -0,063 | 0,456 |
rs703842 | CYP27B1 | -0,467 | 0,316 | -0,391 | 0,401 | 0,549 | 0,036 | 0,525 | 0,045 | -0,041 | 0,631 | 0,046 | 0,589 | -0,064 | 0,335 | -0,022 | 0,738 |
rs1805011 | IL4R | -13,530 | 0,986 | -13,774 | 0,986 | -2,094 | 0,024 | -1,752 | 0,053 | 0,559 | 0,049 | 0,497 | 0,073 | 0,193 | 0,382 | 0,212 | 0,329 |
rs2076753 | CARD15 | -1,152 | 0,044 | -1,300 | 0,023 | 0,093 | 0,738 | 0,137 | 0,625 | 0,062 | 0,483 | 0,057 | 0,526 | 0,000 | 0,998 | -0,059 | 0,397 |
rs2066842 | CARD15 | -1,260 | 0,028 | -1,416 | 0,013 | -0,039 | 0,884 | 0,083 | 0,757 | 0,037 | 0,669 | 0,014 | 0,871 | 0,028 | 0,673 | -0,038 | 0,560 |
rs2066843 | CARD15 | -1,221 | 0,033 | -1,301 | 0,023 | -0,066 | 0,813 | 0,055 | 0,842 | 0,007 | 0,939 | 0,010 | 0,912 | 0,016 | 0,819 | -0,041 | 0,544 |
rs2076756 | CARD15 | -1,396 | 0,031 | -1,427 | 0,027 | -0,142 | 0,627 | 0,073 | 0,800 | 0,077 | 0,410 | 0,055 | 0,552 | 0,035 | 0,627 | -0,029 | 0,680 |
rs375947 | IL12RB1 | 1,012 | 0,011 | 0,580 | 0,125 | 0,117 | 0,653 | 0,087 | 0,733 | 0,133 | 0,116 | 0,063 | 0,443 | 0,140 | 0,027 | -0,011 | 0,858 |
rs2244719 | CYP24A1 | 0,257 | 0,407 | -0,029 | 0,931 | -0,045 | 0,817 | 0,184 | 0,389 | 0,139 | 0,029 | 0,025 | 0,723 | 0,165 | 0,001 | 0,114 | 0,031 |
rs2296241 | CYP24A1 | 0,042 | 0,889 | 0,548 | 0,125 | 0,101 | 0,609 | -0,018 | 0,934 | 0,160 | 0,012 | 0,030 | 0,669 | -0,058 | 0,236 | 0,039 | 0,463 |
rs2248137 | CYP24A1 | -0,104 | 0,776 | -0,253 | 0,503 | 0,320 | 0,145 | 0,117 | 0,609 | 0,038 | 0,599 | -0,024 | 0,748 | -0,120 | 0,028 | -0,131 | 0,021 |
rs2762943 | CYP24A1 | 15,934 | 0,986 | 15,861 | 0,986 | -3,140 | 0,041 | -3,193 | 0,036 | -0,146 | 0,763 | -0,195 | 0,684 | -0,878 | 0,018 | -0,784 | 0,033 |
rs2248359 | CYP24A1 | -0,109 | 0,793 | -0,460 | 0,245 | 0,230 | 0,345 | 0,057 | 0,805 | -0,023 | 0,766 | -0,019 | 0,803 | -0,137 | 0,025 | -0,112 | 0,056 |
rs2426496 | CYP24A1 | 0,415 | 0,403 | -0,091 | 0,848 | -0,045 | 0,886 | -0,225 | 0,464 | 0,207 | 0,038 | 0,165 | 0,091 | -0,060 | 0,436 | -0,076 | 0,314 |