Single cell RNA sequencing identifies IGFBP5 and QKI as ciliated epithelial cell genes associated with severe COPD

Table 7 GSEA enrichment results of the different clusters with the differential gene expression of the LTRC (COPD Gold 4 vs. non-smokers)

	Size	ES	NES	NOM p-value	FDR q-value	FWER p-value
Mast cells	70	− 0.62	− 1.72	0.00	0.07	0.04
Proliferating macrophages	164	− 0.56	− 1.71	0.01	0.04	0.05
Monocytes	103	− 0.63	− 1.58	0.03	0.10	0.12
FBPB4 macrophages	27	− 0.61	− 1.46	0.04	0.15	0.23
AT2	80	− 0.56	− 1.56	0.06	0.09	0.14
B cells	48	− 0.47	− 1.42	0.07	0.14	0.28
Club	83	− 0.51	− 1.38	0.09	0.16	0.32
Fibroblasts	245	− 0.49	− 1.45	0.12	0.13	0.24
Cytotoxic T cells	30	− 0.54	− 1.33	0.13	0.16	0.39
Low quality T cells	126	− 0.45	− 1.38	0.13	0.14	0.33
Ciliated	55	− 0.48	− 1.17	0.30	0.30	0.57
T cells	36	− 0.42	− 1.14	0.32	0.30	0.60
Endothelial	94	− 0.36	− 0.93	0.53	0.51	0.76
AT1	221	− 0.12	− 0.56	0.97	0.99	0.92
NK cells	23	− 0.21	− 0.55	0.97	0.93	0.92

ISSN: 1465-993X